网上协议离婚可以在司法部门的官网或县级以上人民法院的官网申请，在这里就介绍司法部门官网的申请流程。
首先，申请人需要登录司法部门的官网，进入离婚登记申请系统。在系统里填写离婚申请表格，输入个人信息、婚姻情况、财产分割、子女抚养等相关内容，然后附上离婚协议书和相关证明材料。
其次，申请人需要确认信息填写无误，并支付相关的费用（根据不同地区和情况，费用不同）。支付成功后，系统会自动生成一份离婚申请书，需要申请人进行签字确认。
最后，申请人需要将签字确认的离婚申请书以及相关证明材料上传至系统，并等待司法部门审核。审核通过后，司法部门会将离婚登记证明邮寄给申请人。整个过程比传统的离婚审批流程简单快捷，且方便申请人随时随地进行操作，大大提高了离婚效率和满意度。
