如果南京的离婚协议书丢失了，那么首先要做的就是尽快与原来的离婚律师或者法院联系，询问是否存有备案或者副本。
如果存在备案或副本，就可以通过提供相关信息和身份证明重新获取原件或复印件，然后重新签字确认即可。
如果不存在备案或副本，那么就需要及时与另一方联系，协商达成新的离婚协议书，并重新进行签署与认证，以保证后续的离婚手续能够顺利推进。
另外，如果丢失的离婚协议书涉及财产分割、抚养子女等重要问题，建议尽快与律师进行联系，并及时申请法院的裁定，以保护自己的合法权益。
总之，无论是丢失离婚协议书还是其他法律文件，尽快采取行动，与相关人员联系并及时补救是非常重要的。同时，在签署相关协议前，应认真阅读、审慎考虑，并咨询专业人士意见，以避免后续纠纷与争议的产生。
