小孩三个月时不能协议离婚。婚姻是家庭的基本单位，而儿童是家庭中最脆弱的一部分。根据《中华人民共和国婚姻法》规定，离婚必须要在符合法律规定的条件下进行，并且离婚后的子女抚养、监护等问题需要婚姻法庭进行判决。
对于年龄较小的儿童，父母的离婚会对其造成极大的心理和生活上的影响。在三个月的年龄段内，婴儿对外界的环境和事物都还没有形成正式的认知和意识，如果家庭出现问题则需要父母尽可能地维护家庭，避免对孩子造成伤害。
同时，在婚姻法庭的裁判中，也会按照儿童的成长发展阶段来进行抚养、监护等方面的判定。因此，如果父母在孩子三个月时就协议离婚，那么对于孩子的影响不仅是心理上的不稳定，还可能波及到儿童的涉法方面的利益。
总之，在孩子三个月时，父母应该尽全力维护家庭，关注孩子的成长发展，避免对其造成伤害和不良的影响。如果夫妻真的不能和谐相处，可以通过各种途径寻求法律咨询和支持来解决问题，以保障孩子和家庭的权益和稳定。
