是的，协议离婚可以多次申请。在离婚协议中，夫妻双方可以达成一致意见解决财产分割、抚养子女和探视等问题，并提交至法院审理。如果法院认为协议离婚的程序符合法律规定，且真实有效，那么就会作出离婚判决。
但是，有时夫妻双方在签订协议后，可能会在财产、抚养子女或其他方面发生分歧，导致协议无法执行。这种情况下，双方就需要重新协商，并可以再次提交协议离婚的申请，以达成更好的协议。
此外，如果双方重新协商无果或有重大变更，也可以选择到法院申请变更或撤销协议离婚。因此，协议离婚虽然通常只需要办理一次，但在实际情况下可能需要多次申请或调整。
