拆迁协议可以作为行政起诉的依据，但需要具体分析情况。首先，拆迁协议是在法律框架内的深圳市政府对拆迁补偿进行的立法。因此，凡是按照拆迁协议执行的拆迁补偿都是有法律效应的。其次，如果拆迁协议中的条款与法律规定不符，也可以通过行政起诉进行维权。
当然，对于一些非正规的拆迁行为，如违法强拆、强行驱赶等，拆迁协议就不再具有约束力。针对这种情况，受害人可以选择向公安机关报案，同时，也可以起诉违法拆迁行为，通过法律途径争取自己的权益。
总的来说，拆迁协议可以是行政起诉的一个依据，但具体情况需要结合实际情况进行判断。如果是按照法律规定执行并获得了拆迁协议的保护，那么可以利用拆迁协议来维权；如果是遭受非正规的违法拆迁行为，那么可以通过起诉等方式来寻求法律保护。
