如果一方已经申请了协议离婚，后来又有感情上的复合或其他原因，想要撤销协议离婚申请，需要采取以下步骤：
1. 提出申请：需要向原本受理离婚申请的民政部门或法院提出书面申请，说明希望撤销离婚申请的原因和情况。
2. 签署协议：如果双方均希望撤销离婚，需要双方协商签署一份协议书，详细说明双方希望恢复原有婚姻关系的意愿和具体措施。如果只有一方希望撤销离婚，可以由该方与原来提出离婚的一方协商并签署协议，经过双方签字盖章后提交民政部门或法院备案。
3. 处理手续：提交书面申请和协议书后，需要等待当地民政部门或法院的处理。如果申请符合要求，民政部门或法院会撤销原来的离婚申请，从而恢复原有的婚姻关系。
需要注意的是，如果离婚申请已经被法院判决并生效，就无法通过撤销申请来恢复原有婚姻关系。因此，在提出离婚申请前，双方应当认真考虑和咨询专业的律师建议，避免错误的决定给自己和家庭带来无法挽回的后果。
