农村宅基地翻盖二楼的合法性存在争议，这主要取决于当地的法规和政策。一般来说，农村宅基地的利用应遵循农村土地利用规划、宅基地管理规定和相关建设标准，但各地的标准和规定不尽相同。
按照《农村宅基地条例》的规定，宅基地上的住房建设应当符合建设用地规划、城乡规划和环保要求，且规模、建筑高度等应当符合建设用地规划和宅基地管理要求，但并没有明确规定是否允许翻盖二楼。
在一些地区，政府允许宅基地翻建二楼，但需要符合相关的要求和规定，比如要求建筑面积不得超过一定的限制、建筑结构要符合相关标准、安全措施要完善等。而另一些地区则对宅基地翻建二楼持禁止态度，认为这样会导致建筑过高、超过建设用地规划，无法保证土地的使用效益，并可能对周边环境和生态造成影响。
因此，要想确认农村宅基地翻盖二楼是否违法，需要深入了解当地的政策、标准和规定，并进行合法申请和审批程序。需要强调的是，不管允不允许翻建二楼，都要确保安全和环保，合理利用土地资源，保护农村生态环境，以及遵守相关的法规和规定。
