离婚协议在法院离婚证中的作用十分重要，其起到了决定离婚双方权益和义务的作用。一份离婚协议，通常包含财产分割、财产划分、子女抚养、探视权、赡养费、债务分担、申请离婚后的住所变更等内容。
一旦离婚协议经过双方的签字、公证等程序认证后，该协议就会在法院离婚证中得到体现。离婚协议被称为离婚法院的"裁定书"，在法院离婚证中记载的内容都是经过法律程序认证、生效的。离婚协议的内容如有违反法律的规定，则该协议对双方当事人均没有法律效力。
因此，在离婚协议的签署过程中，双方当事人必须对其中的细节进行仔细考虑，确保该协议符合法律规定，且双方权益和义务得到合理保障。如果双方在签署协议后，发现协议存在问题，则可向法院提起诉讼，要求修改协议或撤销协议。
