拆迁协议公证和抵押合法性是在不同层面的问题。拆迁协议公证是一种对于房产拆迁协议的公证服务，公证书上将具体的协议内容予以确认，为涉及到拆迁协议的各方提供保障。而抵押则是指将自己的财产作为担保，向银行等金融机构借款的行为，是一种常见的信用评估方式。
拆迁协议公证合法性得到了法律明确的规定，根据《公证法》第二十二条规定，公证行为确认的文书具有证明当事人陈述内容的重要法律意义，可以作为涉及当事人行为、权利、义务的证明文件。因此，拆迁协议公证可以有效地保护房产买卖双方的合法权益，减少纠纷发生的可能。
而抵押合法性则需要在具体的情况下进行判断。抵押是否合法要考虑抵押行为是否违反了《担保法》以及其他法律规定，同时需要考虑借款方和贷款方是否有充分的协商和合法的合同文件。如果借款方已经充分了解了抵押的内容并且签署了相关的合同文件，则抵押行为是合法的。
在实际操作中，拆迁协议公证和抵押往往联系在一起，因为拆迁协议涉及到的房产往往是财产抵押的对象。在这种情况下，抵押方需要考虑拆迁协议的内容以及公证机构对协议的确认是否有法律效力。如果拆迁协议在公正的情况下并获得了法律认可，则相应的财产抵押也是合法的。
总的来说，拆迁协议公证和抵押都是有法律依据的常见行为，但具体是否合法需要根据情况具体判断，要充分考虑法律规定以及合同文件的具体内容。
