在处理拆迁协议问题上，政府需要遵循的原则有以下几点：
第一，公平合理。政府应当确保拆迁协议的签订过程公开透明，公平合理。政府要确保各方能够平等谈判，避免强弱双方的不对等地位而导致的签订不合理的协议。
第二，坚持以人为本。政府要尊重居民的合法权益，保护居民的合法利益。在签订拆迁协议时，必须充分考虑到居民的基本生活需求、健康和安全等因素，确保其生计、就业和居住等方面的权益得到充分保护。
第三，合法合规。政府在处理拆迁协议问题时，必须遵守相关法律法规，严格按照法定程序进行拆迁，确保拆迁协议的合法性和合规性。
第四，科学合理。政府在签订拆迁协议前，必须进行综合评估和分析，充分考虑到土地、环境、经济、社会等多个因素，确保拆迁协议的科学性合理性。
以上是政府在处理拆迁协议问题上需要遵循的基本原则。政府必须深入了解当地情况，了解各方诉求，坚持公平公正、法治原则，切实保障人民的利益，做好各项保障措施，保护好被拆迁人的合法权益。同时，政府还应该适时公开拆迁协议，接受舆论监督，让公众对政策有更清楚的了解和认识，从而增强大家的信心和支持。
