协议离婚通常是指夫妻双方自愿离婚，达成协议并向法院申请离婚。在协议离婚中，双方可以自主商定财产分割、抚养子女、探望权等事项，以达到和平离婚的目的。
对于是否能在协议离婚中承认出轨，首先需要明确的是，婚姻法规定，夫妻双方应当忠诚、互相信任，不得有不正当的婚外情。虽然法律没有要求在离婚时必须揭露婚外情事实，但在实际操作中，因为出轨的行为已经违反了法律的规定，因此在协议离婚过程中承认出轨可能会对原配做出一定的补偿。
在协议离婚中承认出轨，是否会影响离婚协议的达成以及最终离婚的结果取决于具体情况。如果出轨行为对离婚财产和子女抚养等方面没有影响，那么承认出轨不会对离婚协议的达成产生太大影响。但如果出轨行为对上述事项有所影响，那么出轨方可能需要在离婚财产分割中做出更多的让步，同时也可能会影响子女抚养、探望等具体事项的协商。
在实践中，若出轨已被证实，协议离婚时可能会考虑出轨一方支付更高的赡养费或抚养费等，同时在财产分割中也可能做出更多让步。在庭审中，如果涉及出轨问题，一些法院或许会对出轨一方做出谴责，以制约滥用婚姻自由的行为。
总的来说，协议离婚中承认出轨可能会对离婚结果产生一定的影响，因此在决定如何协商离婚协议时，双方需要在法律框架下进行谈判，根据具体情况做出决策，以达到和平协商离婚的目的。
