农村宅基地与商品房存在着一些矛盾，主要体现在以下几个方面。
首先，农村宅基地的性质不同于商品房。宅基地是农村居民自愿以自己的集体经济组织的土地为基础，按照法定程序依法取得的，专供自己居住和生产经营使用的土地。而商品房则是以经营性质而存在，开发商投资盈利的产物。两者的性质存在差异，可能会在土地使用、产权归属等方面引起矛盾。
其次，农村宅基地的建设、管理、使用等方面存在一些法律规定和约束。而商品房则是在市场需求和开发商利益的推动下建设和出售。两者的管理和使用方式不同，也容易带来矛盾。例如，在农村宅基地上建设商品房可能涉嫌违法，而商品房开发商在开发过程中也可能挖掘农村宅基地的一些资源而引起农民的不满。
最后，农村宅基地的土地利用价值与商品房的市场价值存在差异，土地使用权价值低于产权价值。因此，在农村宅基地上建设商品房可能会引起土地流转等问题，影响农民的生产生活，进而引发社会矛盾。
综上所述，农村宅基地与商品房本质上存在着一些矛盾，需要在土地利用、产权归属等方面进行合理规划和管理，以实现农村宅基地与商品房的和谐共存。
