当申请离婚的一方与另一方在离婚协议的内容上存在分歧时，离婚程序会面临一定的困难。如果另一方不同意离婚，那么就需要针对不同意离婚的原因进行处理，以达成共识或者寻求司法裁决。
一、寻求调解或仲裁
在另一方不同意离婚的情况下，可以向当地司法机关或者人民调解委员会提交申请，寻求调解或仲裁。在调解或仲裁过程中，第三方会协调并调解双方的分歧，尝试达成共识，实现离婚。
二、起诉离婚
如果调解仍然无果，可以采取起诉离婚的方式，分别委托两个律师对离婚协议进行谈判达成共识。如果在这个过程中还是无法协商成功，可以请求法院出面介入解决，来判定离婚协议的内容，以现有法律规定为依据，实现离婚。
三、协商调解
此外，如果遇到另一方不同意签署离婚协议等情况，也可以考虑采取协商调解的方式。可以约定见面时间，并在见面时，进行公正协商并达成共识的方式解决分歧。
总之，当申请离婚的一方与另一方在离婚协议的内容上存在分歧时，需要采取有效的方式协商解决。当然，最好的方式还是协商达成共识，并尽可能保护两人各自的利益，遵循法律规定，达成真正的“和离”效果。
