拆迁协议是一项涉及到国土资源、城市规划、房屋征收等多个领域的综合性协议，需要多个部门协调配合。在中国，拆迁协议主要由国土资源管理部门和城市规划管理部门共同管辖。
国土资源管理部门主要负责土地征收和补偿工作。按照《中华人民共和国土地管理法》和《中华人民共和国城市房地产管理法》的规定，国有土地只能由国家代表土地出让，个人和单位不能自行占有土地并开发建设房屋。因此，在拆迁过程中，国土资源管理部门必须依法征收土地，并给予拆迁户合理的补偿。
城市规划管理部门则承担着规划拆迁区域、编制拆迁计划以及审批拆迁方案等职责。城市规划管理部门根据城市规划和公共利益，对需要拆迁的区域进行规划调整，拆除违法建筑和房屋，为城市建设和发展提供必要的土地和资源。
除了国土资源和城市规划管理部门之外，拆迁协议还需要其他相关部门的协调配合。例如，有关住房和城乡建设部门需要参与拆迁安置计划的编制和实施，公安、交通、消防等部门需要协助保障拆迁人员的安全和交通秩序。
总之，拆迁协议是一个多部门联合管辖的综合性协议，各相关部门在协商拆迁方案、土地征收、房屋征收、拆迁补偿、安置等方面都扮演着重要的角色，共同推进城市建设和发展。
