在潍坊市，协议离婚可以在以下几个部门和机构办理：
1. 婚姻登记处：如果您的婚姻是在潍坊市内登记的，您可以前往婚姻登记处进行办理。需要提供夫妻双方的身份证和结婚证原件，填写协议离婚协议书并签字即可。
2. 民政局：如果您的婚姻是在潍坊市外登记的，您可以前往当地的民政局进行办理。办理时需要提供夫妻双方的身份证和结婚证原件，填写协议离婚协议书并签字即可。
3. 律师事务所：在离婚过程中，如果遇到难以协商的问题，可以请律师进行调解。如果夫妻已经协商好离婚事宜，可以请律师审核协议书和双方签字确认。
4. 人民调解委员会：如果夫妻双方协商好离婚事宜，但在签署协议时未能达成一致意见，可以请人民调解委员会进行调解。
总之，办理协议离婚需要夫妻双方共同前往相关部门或机构，携带身份证、结婚证原件等相关证件材料，并填写协议离婚协议书并签字。如果在办理过程中遇到问题，可以请专业人员进行调解或代理。
