申请书主要包含以下内容：
一、案情介绍
首先，需要简要介绍涉案的基本情况，包括矛盾、争议的起因、双方的主张和相关证据。
二、理由分析
其次，需要对协议无效的理由进行分析，例如协议内容违法、双方不平等、协议签署时的欺诈、威胁或误导等情况。要结合事实和法律法规的规定，深入分析为什么认为拆迁协议无效。
三、申请诉讼请求
最后，对法院提出具体的诉讼请求，请求诉讼结果应该包括：判令拆迁协议无效，要求对方恢复原状并给予相应赔偿，同时请求法院保护申请人的合法权益。
在整个申请书的撰写过程中需要充分证明申请人的诉讼请求，提供相关的证据，以及阐述相关法律规定和判例案例等。值得注意的是，申请书的撰写需要严格遵守法律程序，确保具有适用法律的效力和可操作性。
