如果夫妻协议离婚时不同意协议的内容，应该从以下几个方面来处理：
1. 重新谈判
夫妻双方可以重新协商，重新谈判规定离婚协议的内容。在协商的过程中需要保持沟通，理解对方的观点和需求，并尽量做到平等互利。
2. 寻求调解
如果夫妻双方无法在谈判中达成协议，可以寻求专业的调解机构提供帮助。调解是一种非正式的纠纷解决方式，它可以促进夫妻间的对话和理解，帮助双方更好地达成共识。
3. 提起诉讼
如果夫妻双方谈判和调解都无法解决争议，可以考虑通过法律程序来解决。提起诉讼是离婚争议的最后选择，也是最为庄重的方式。在提起诉讼前，夫妻应该了解相关法律法规的规定，积极准备案件的事实和证据。
总之，当夫妻在协议离婚时无法达成一致时，双方应该充分认识到离婚可能会对双方造成的经济、心理等方面的影响，理性处理争议，通过谈判、调解和诉讼等方式来解决问题，以减少离婚对双方和家庭的损害。
