法院判决离婚后达成的协议一般情况下是有效的。在离婚诉讼中，当双方对离婚财产分割和子女抚养问题达成一致意见的时候，法院会将双方协议纳入判决书中，并予以执行。因此，离婚协议在离婚诉讼中起到了很大的作用。
但是，也有一些情况下，协议可能会失效。例如，在达成协议的过程中出现重大瑕疵，比如一方欺骗另一方，导致协议签订不公平；或者当事人一方未经经济状况评估的情况下签订了不公平的协议；或者协议内容涉及违法或不道德的行为等，这些情况下，协议将被视为无效。
此外，就算协议是否有效，其仍可能被修改或撤销。当一方在签订协议后发现自己有不利的情况，或者一方的经济状况发生了变化，都可以要求修改协议。同时，如果协议当事人自主签订协议中的内容已过时或者存在较大争议，可以要求撤销协议。
综上所述，法院判决离婚后达成的协议有效性因具体情况而定，如果协议未出现重大瑕疵或违法行为，双方自主签订的协议一般会被视为有效，并被广泛应用于离婚诉讼中。但是，在实际过程中，需要特别注意协议的合法性和合理性，以免影响自己的利益。如果存在任何疑虑，应该寻求专业律师的帮助。
