拆迁协议一般存档于房屋所在地的村、镇、街道等政府部门。具体来说，拆迁协议的存档主要分为以下几个层次：
1. 基层存档。在房屋拆迁的某个村、镇、街道政府部门会建立一个拆迁档案，将拆迁协议等相关文件存放在其中。这样做是为了在需要的时候进行查阅和核实，确保拆迁的公正性和合法性。
2. 地区存档。有些地区会设立拆迁办公室或专门机构，来负责拆迁项目的管理和监督，存档也会相应地放在这些机构里。同时，地方政府可能也会对拆迁行动进行总的记录，这时候拆迁协议也会被归档在政府档案馆或综合档案办公室等地。
3. 国家存档。在一些极其重要的拆迁项目中，国家也会参与其中，此时拆迁协议会被中央政府或国家档案馆所存储。
需要注意的是，拆迁协议的存档可以有多个副本，例如在当地政府机构和相关企业也可能保存有一份拆迁协议的副本，以便在需要的时候进行查阅。但不管在哪里存放，拆迁协议的安全性和保密性都非常重要，这样才能保证拆迁协议的真实性和合法性，同时也能够保护当事人的合法权益。
