上海农村宅基地证的办理需要遵循一定的程序，具体如下：
1. 首先，农村居民需要在当地农村村委会进行申请，提供相关的材料。
2. 提交完整材料后，相关部门将根据农村居民的宅基地情况进行勘测。
3. 完成勘测后，农村居民需要再次提交材料，包括宅基地建设方案、土地利用申请书等相关文件。
4. 提交完整材料后，县级国土资源部门将根据相关法律法规对材料进行审批。
5. 经过审批后，相关部门将颁发宅基地证，此时农村居民才合法拥有宅基地的所有权和使用权。
需要注意的是，不同地区的具体办理程序可能略有不同，具体还需根据当地实际情况进行处理。同时，在办理的过程中，要严格按照国家规定的法律法规进行操作，以避免出现任何的纠纷和问题。
