是可以的。虽然协议离婚是双方自愿达成的协议，但离婚对子女的抚养权和财产分配都有着严格的法律规定。如果一方认为另一方不适合照顾孩子或者不公平分配了财产，他们可以提起诉讼申请争取自己的合法权益。
在离婚案件中，争议最多的就是对子女的抚养权。根据中国婚姻法，父母要共同承担子女的抚养教育费用，但如果一方有特殊原因无法履行抚养义务，另一方可以申请独立行使抚养权。如果双方都有能力照顾孩子，那么法院会考虑孩子的意见、父母的工作条件和抚养经验等因素，做出最有利于孩子的决定。
对于财产分配方面，如果双方在协议中已经达成一致，法院会尊重双方的意愿进行判决。但如果一方认为分配不公平，他们可以向法院提起诉讼请求重新分配。这时，法院会根据财产来源、婚姻期间的贡献和离婚后的生活情况等因素综合考虑，在公平、合理的基础上进行分配。
总之，协议离婚并不意味着所有问题都得到解决。如果一方认为自己的权益受到了损害，他们可以通过诉讼途径争取自己的权益。不过，在离婚过程中，保持冷静理智、尊重法律是非常重要的。离婚不仅会对双方造成心理上的伤害，对子女的成长也会产生不良影响，因此当事人应该尽可能地减少矛盾、和解分手，以最少的伤害结束婚姻关系。
