如果夫妻双方签订了怀孕协议并且达成了离婚协议，那么离婚手续还是需要按照法律规定办理，包括以下步骤：
1. 协商财产分割。夫妻双方应该就共同财产进行协商，如果达成一致意见，则可以直接办理财产分割手续。如果分歧比较大，可以请律师协助调解或者提起诉讼。
2. 对子女的监护权达成一致意见。如果夫妻双方都认为孩子要随母亲生活，那么就应该明确申请母亲获得子女监护权的手续。
3. 缴纳离婚登记费和相关手续费用。
4. 填写离婚申请书。离婚申请书需要详细填写夫妻双方的基本情况，以及财产分割和子女监护的具体安排。
5. 提交离婚申请。夫妻双方可以到当地的婚姻登记机关或者法院提交离婚申请，同时递交相关证明材料。
6. 等待法院审理。如果夫妻双方没有争议或者没有涉及到特别复杂的问题，离婚手续可以在数月内办理完毕。
总之，尽管夫妻双方已经签订怀孕协议并且达成了离婚协议，但离婚手续仍然需要按照法律规定办理。如果夫妻无法达成一致，可以请律师协助调解或提起诉讼。
