分居协议往往涉及到抚养权、探望问题、财产分配等，在离婚案件中起到了重要的作用。从法律层面上来讲，离婚无非是将原本共同的财产、抚养权等方面进行分割，取得法律效力。因此，要回答这个问题，我们需要从以下几个角度来理解。
首先，分居协议的签订并不意味着对子女的抚养权产生任何影响。无论是在分居协议还是离婚协议中，对于子女的抚养权保障依然是以其最大的利益为目的，法院不会因为离婚协议而忽视子女的利益。如果离婚协议与子女的利益相冲突，并且此冲突未被纠正，法院可以根据实际情况对离婚协议的有效性加以修改、废除等。
其次，分居协议可能会影响到离婚中的财产分裂问题。在分居协议中，夫妇双方可能就共同财产的分配达成一致意见，从而影响到离婚中划分财产的比例和范围。但是，在分配共同财产时，必须考虑各自的身份、财产得来方式、财产来源等因素进行公正分配。
最后，分居协议有可能对探望子女的问题产生影响。在分居协议中，离婚双方往往会就子女的探望做出具体的安排。而在实际操作过程中，如果父母之间的协议存在不合理性，比如一方经常刁难、不让探视等，还是要依据法院的调解和判决做出判断和处理。
总之，分居协议对于离婚案件的影响因个案而异。对于抚养权、财产和探视等方面的细节，还需要具体情况具体分析，并且在法院的判决和调解下得到公正处理。
