离婚协议按指纹需要按两手，因为通过双方的手指印可以确保协议的真实性和合法性。按指纹是一种认证手段，能够有效避免合同的作假，提高合同的可信度和可靠性。
在具体的操作中，通常是双方都需要去公证处或律师事务所按指纹，然后由相关机构将指纹考录在案，并加盖公章或律师章。这样，当有争议时，可以通过指纹来判别协议的真伪，从而保护双方的权益。
同时，为了确保协议的有效性，离婚协议的制定还需要注意以下几点：
1. 协议内容要清晰明确，尽量避免歧义，确保双方都能理解和接受。
2. 协议要符合法律规定，如果协议中有不合法内容，可能会被法院认定为无效。
3. 协议要公平合理，不能有一方过于偏袒，否则也可能会被法院认定为无效。
4. 协议要尽量排除后患，考虑到双方未来可能出现的情况并做好处理措施。
总之，离婚协议的签订需要认真对待，双方要充分沟通协商，避免不必要的误解和矛盾，以达成公平合理的协议，从而保障双方权益。
