离婚后房子补充协议需要在房产所在地的房地产管理部门办理。具体操作步骤如下：
1. 联系房产所在地的房地产管理部门，了解相关手续和材料要求。
2. 编写补充协议，内容包括双方离婚后对房产的分配、房产登记证书的处理等。
3. 准备所需材料，包括离婚证书、房产证、国民身份证、补充协议原件等。
4. 前往房地产管理部门办理手续。具体操作流程根据不同地区可能会有所不同，但一般情况下需要先进行资料审核、签字确认、缴纳相关费用等。
5. 处理完成后，双方可以领取新的房产登记证书，确认房产的所有权归属。
需要注意的是，离婚后如何分配房产是一个比较复杂的问题，往往需要根据双方的具体情况做出判断。对于一些较为复杂的情况，例如房产产权归属不明确、房产价值的评估等问题，建议寻求法律咨询或者司法机关的帮助。
