北京市的农村宅基地是指农村居民的合法住房用地，旨在保障农村居民的住房需要。虽然宅基地是农村居民私人所有的土地，但是也需要受到政府的管理和规范。
根据《北京市宅基地条例》，北京市管辖下的农村宅基地占地面积不得超过每户5亩，重点是实行宅基地使用集中审批制度，严格控制农村宅基地划拨规模，科学规划宅基地等方面。
此外，北京市还出台了《北京市农村土地利用总体规划》，明确了农村土地利用方式和布局，规定了宅基地“三线”、建设用地指标等规划标准，为宅基地管理提供了指导。
最后，北京市政府还加强了宅基地的监管和执法，对违规宅基地进行限期整治和取缔，加大违规宅基地的处罚力度，以保护良好土地资源的利用和环境的卫生。
综上所述，北京市的农村宅基地超占问题的管理主要由政府规划、审批、监管和执法来实现，以保障农村居民的住房需要，保护土地资源和环境。
