协议离婚是指夫妻双方在婚姻关系破裂时，通过协商达成的离婚协议， 双方自愿解除婚姻关系，分割财产，约定抚养子女等事项，而不必经过诉讼程序。在协议离婚中，由于涉及到夫妻双方的合法权益，因此需要进行法律程序的确认和认可。具体而言，其程序如下:
1.协议离婚需要双方达成一致意见，即夫妻双方签署离婚协议书，并经过公证机关公证；
2.公证机关在公证书上加盖公章，并注明双方当事人的姓名、身份证号码、地址等信息；
3.公证书具有法律效力，可作为离婚证明，但离婚协议的内容一定要符合法律规定，如财产分割比例公平合理，抚养子女的约定符合法律要求等。
需要特别注意的是，如果协议离婚中存在一方对另一方的暴力，威胁等行为，或者存在一方在签订离婚协议期间受到欺骗等情形，则不应允许协议离婚。此外，如果协议离婚中存在的约定违反法律规定，或者造成了一方明显的经济利益损失，那么离婚协议书也不能起到法律效力。
因此，如果离婚协议书具有法律效力，且没有违反法律规定，依照公民的权利，协议离婚可以在离婚申请书中提出，并申请法院确认。但是，如果离婚申请被法院驳回，也需要依照法律规定，通过诉讼程序进行离婚。
