协议离婚后，夫妻在分割夫妻共同财产时，如果有涉及到共同经营的公司，一般需要按照以下步骤去分割：
1. 确认公司所有权归属：根据公司的股权结构，确定夫妻双方各自持有的股份比例，以及是否存在其他投资方。如果夫妻双方所持有的股份比例不一致，需要通过协商或者司法途径来确认公司所有权归属。
2. 确认财产评估：对公司的资产、负债以及未来经营前景进行评估，以确定公司当前的价值。如果有必要，可以雇佣专业评估机构来进行评估。
3. 制定分割方案：根据夫妻双方所持有的股份比例和公司的当前价值，制定分割方案。分割方案可以包括将公司股份分别分给夫妻双方，或者将公司出售后分配资金等。
4. 转移公司所有权：根据分割方案，通过股权转让或者公司出售等方式来完成公司所有权的转移。
需要注意的是，在分割共同经营的公司时，一定要确保公司的正常经营不受影响。如果夫妻双方无法达成一致，可以通过司法途径来解决。
