协议离婚后，如果男方不在，那么女方可以通过以下几种方式来解决问题：
1. 尝试联系男方：女方可以通过各种方式（如电话、邮件、短信等）尝试联系男方，并询问其是否愿意与其签署离婚协议书。如果男方不回应，女方可以通过公告等方式通知男方离婚事宜。
2. 寻求法律援助：在离婚过程中，如果女方遇到困难，可以通过司法行政机关等相关部门寻求法律援助。法律援助也可以提供给无力支付诉讼费用的离婚申请人，以达到保障其合法权益的目的。
3. 提交离婚申请书：女方可以在人民法院或司法所等法律机构提交离婚申请书，并要求法院要求男方出庭或委托代理人出庭，以表达其离婚申请的意愿。
4. 请求仲裁：如果无法和男方协商或达成共识，女方可以向劳动仲裁机构或民间有关调解组织提交申请，请求对离婚问题进行仲裁。仲裁决定在法律上具有强制执行力，可以保护女方的利益。
总之，在协议离婚后，如果男方不在，女方应该积极地寻求法律援助，并妥善处理离婚的各种问题。同时，女方也应该充分了解自己的权利和义务，以维护自己的合法权益。
