重庆农村宅基地的申请费用会根据不同地区、不同情况而有所差异，但通常来说，申请费用在3000元到10000元之间。
具体来说，根据《重庆市宅基地管理办法》，重庆市其它区域的农村宅基地申请流程需要交纳不同的费用。
申请村委会组织集体土地使用权出让而设立宅基地，需要缴纳不超过10元/㎡的集体土地出让金。并且根据本次土地使用规划区域内土地市场自由化程度和市场需求情况，可以适当优惠。
而在直辖市九龙坡区，根据《重庆市九龙坡区宅基地管理办法》，宅基地户口农户无须缴纳申请费用。但须审核通过后，每户须交纳500元用于土地平整、水泥墙建造等施工用钱。如果是土地的流转和转让，则需要按照市场标准缴纳相关税费。
综上所述，无论在哪里申请重庆农村宅基地，一般来说需要缴纳申请费用，具体的费用以当地政府规定为准。
