是的，离婚协议可以多年后公证。离婚协议一旦达成，双方应在法律规定的期限内提出申请办理离婚手续。离婚协议虽然是当事人自愿达成的协议，但是如果当事人想要在将来的时间内证明协议的有效性，就需要将其公证。
公证是指由法定的公证机关根据双方当事人的申请，对公证当事人提供的相关事实进行证明，并在印章下附注公证书，证明手续已经符合法定要求。从实践层面感受来说，公证作为一种证明手段，功能不仅仅是认定和证明事实，而且体现了事实的法律效力和证据力。
因此，对于离婚协议，已经多年过去了，双方当事人觉得有必要将协议公证作为有效证据使用时，可以到公证机关进行公证。公证可以证明协议的存在、当事人的真实意愿和确切内容等。而且，公证书具有证明文件的性质，往往会被法院所采信。
总的来说，离婚协议虽然是双方自行达成的协议，但是公证可以更好地证明协议的真实性和有效性，尤其是对于一些特殊情况或诉讼时，公证书可以作为有力的佐证。
