是的，立案后协议离婚仍需要去法院进行正式的手续。协议离婚是一种通过双方自愿协商达成离婚协议的方式，双方需要在离婚协议上签字，达成离婚协议后，需要去法院进行正式立案，由法院判决发出离婚证书。
在离婚协议达成后，双方需要去法院对离婚协议进行审批，并且进行诉讼进行离婚，提交离婚证明材料，如结婚证、身份证、户口本等。法院需要对所提供的证明材料进行审查，并且核实离婚协议的合法性、合理性。
在此过程中，如果双方存在争议，法院还需要调解解决争议，达成双方都能接受的协议。如果经过调解并无法协商达成意见，法院将组织庭审，裁决最终离婚结果。
因此，立案后协议离婚需要在法院进行正式的手续，需要确保离婚协议的合法性，以及最终达成的离婚裁决的合理性。
