公证的抚养权协议可以补办，但需要符合一定的条件。首先，需要确认所涉及的抚养权协议是否具有法定效力。如果该协议已经具有法定效力，那么补办的过程就比较简单，只需要在原公证机关办理新的公证手续即可。
但是，如果该协议不具有法定效力，就需要重新协商达成一份新协议，并再次办理公证手续。此时需要注意，新的协议必须在法律和伦理上都合理和可行，在双方协商达成的基础上才能公证。如果新协议仍然存在争议或者不合理的情况，公证机关可能会拒绝受理。
总之，公证的抚养权协议可以补办，但需要满足一定的条件，确保新的协议合法有效。另外，补办公证协议也需要重新支付公证费用。因此，在签署抚养权协议时，双方要认真谨慎，尽量避免可能发生的问题。
