协议离婚是一种双方都同意离婚并签署离婚协议书的形式，相比于诉讼离婚来说，不仅时间更短，并且费用也较为低廉。而协议离婚的分居期则是指夫妻分居后一方申请离婚，需分居一定时间后方可办理离婚。
根据中国婚姻法规定，夫妻分居一年后，如果双方都无异议，可以办理离婚手续。因此，协议离婚分居一年后是可以办理离婚的。
在分居期间，双方可以根据离婚协议书约定分割财产、抚养子女、赡养老人等具体事宜，以解决离婚后可能出现的纠纷。此外，双方也可以通过协商解决离婚费用等问题。
需要注意的是，协议离婚虽然流程较为简便，但离婚前仍需进行肢体检查等必要程序，以确保离婚双方的健康和安全。此外，如果夫妻双方在分居期间有重大原则分歧，无法协商离婚事宜，将不得不通过诉讼的方式进行离婚。
总之，协议离婚分居一年后可以办理离婚手续。夫妻双方在分居期间应加强沟通，合理协商，尽量达成一致意见，以便顺利完成离婚程序。
