农村宅基地自建房的分配问题，是我国农村土地利用中面临的一个重要问题，涉及到农民利益、村庄管理、土地保护等多方面的问题，需要科学、公正的解决方案。
一般来说，农村宅基地的自建房分配可以按照以下几种方式来进行：
1、自愿协商分配。该方式主要由村委会和农民自愿协商，根据申请人的情况和村庄发展的需要，综合考虑房屋的面积、位置、用途等因素，共同制定一份合理的分配方案。
2、竞买方式分配。该方式主要针对宅基地面积较小，且申请者较多的情况下采用，通过公开竞买的方式，将宅基地划分为若干个同等面积的单元，由申请者报价竞拍，最终最高价者获得该宅基地。
3、抽签方式分配。该方式主要适用于申请者数量较多，而宅基地数量较少的情况下，通过进行公正、公开、透明的抽签来分配宅基地，确保公平公正。
不过，需要注意的是，无论采用哪种方式来分配宅基地，都需要考虑到农民的合法权益，避免出现权益受损等问题。同时，也要扎实推进农村土地制度改革，完善相关法律法规，加强土地保护，确保农民的土地权益和村庄发展的可持续性。
