当父母分开而有两个孩子，如何分配抚养权可以成为一项非常复杂的问题。在这种情况下，父母应该合理划分孩子的居住、抚养、家庭和财产等问题。以下是一些关于如何处理两个孩子抚养权的建议。
首先，父母应该保持沟通，并持开放心态对待孩子的抚养问题。围绕孩子的最佳利益，彼此了解对方的想法和要求，切实地达成协议。如果无法达成一致意见，可以寻求法律和专业咨询，寻求帮助解决问题。
其次，父母需要考虑孩子的年龄和性别等因素。如果两个孩子都很小，那么他们可能需要长时间的陪伴和照顾。此时，交替抚养可以是一种不错的选择方案，也可以考虑共同承担子女的抚养费用，以确保孩子的学习和生活能够顺利进行。
另外，父母还应该考虑到孩子的兴趣和特长、学校环境等。比如，如果一个孩子对音乐有特殊的兴趣，那么应该优先考虑让他在较好的音乐教育环境下成长。在分配居住权上，可以优先考虑孩子的学校和周围环境等因素，这样可以避免多次搬家对孩子带来的不良影响。
最后，父母还应该纠正自己的情绪，不要在孩子面前吵吵闹闹，以免影响孩子的心理健康。父母应该以理智和成熟的态度，合理分配抚养权、财产问题等，以确保孩子的最大利益。
总之，当父母分开而有两个孩子时，家长应该始终以孩子的最大利益为出发点，坦诚交流并理性解决抚养问题，让孩子有一个健康、快乐的成长环境。
