如果拆迁补偿协议遗失，需要尽快采取措施进行补救。首先，应该尽快联系相关部门，例如拆迁办公室或者城管部门，向他们说明情况并咨询如何补办手续。其次，应当持有效证件及原有证明材料，尤其是与拆迁和房产有关的文件、公证书等，证明自己与该房产有过交易往来，并提供相关的证据材料加以证明。
在此基础上，需要进行一些申请手续。首先，应该向属地房产交易中心要求重新开具房产证明，同时向有关部门申请重新办理拆迁补偿协议，以确保自己合法权益得到保障。在申请时，需要注意提供充分、准确的资料，并积极配合有关部门的调查工作。
需要注意的是，在补办手续时，可能会遇到一些困难和难题。例如，可能会出现证明材料不全或不足、有关部门不予受理等等。因此，需要保持耐心和冷静，积极协商和沟通，并根据实际情况调整自己的申请策略，以达到最好的结果。
总之，拆迁补偿协议遗失是一件比较麻烦的事情，但只要认真梳理证明材料、积极申请相关手续，并保持耐心和冷静，是可以成功补办的。
