协议离婚是指双方夫妻在离婚协议书上签字确认离婚，而不是经过法院审判离婚。对于协议离婚手续多年后还会被查的问题，其实这取决于情况。
首先，如果离婚双方后来没有再次结婚，也没有产生任何法律问题，那么协议离婚的手续就不太可能被查。因为在民事诉讼法中规定：“无生效法律文书的记载记载以外，不能认定事实的存在或者内容”。这意味着，除了具有生效法律文件记载以外，其他的事实证据是不能证明协议离婚的存在和内容的。
其次，在某些情况下，协议离婚的手续可能会被查。例如，一方被追究经济赔偿责任、抚养费、房产分割等问题时，协议离婚的笔录就可能成为证据。此外，在移民、贷款、再婚等方面，也会需要提供协议离婚的证明文件。因此，在这些情况下，协议离婚的手续就有可能被查。
总之，协议离婚手续多年后是否会被查还要根据具体情况而定。如果离婚双方没有再次结婚，没有法律纠纷，也没有需要提供协议离婚证明的情况，那么协议离婚手续可能不会被查。但如果存在需要提供协议离婚证明的情况，那么这些手续就有可能被查。
