在协议离婚中没有明确规定存款如何处理的情况下，夫妻双方可以通过自愿协商或者通过诉讼等途径来解决存款问题。
首先，夫妻双方可以自愿协商，商定存款如何处理。一般来说，如果婚姻期间存款来自于双方共同劳动所得，那么双方可以按照比例分配存款；如果存款来自于其中一方的个人劳动所得，那么存款可能会归该方所有。无论如何，夫妻双方应当达成一致意见，并将其写入协议书备案。
如果夫妻双方无法通过自愿协商达成一致意见，可以通过诉讼途径解决。双方可以向法院提起财产分割诉讼，在审理过程中，法院会根据双方的财产状况以及贡献程度等因素来综合考虑就存款分配做决定。这种方式虽然比较麻烦，但是可以实现公平分配。
总之，在协议离婚中没有规定存款如何处理的情况下，夫妻双方应当积极协商解决，或者通过诉讼等途径寻求法律帮助，保护自己的合法权益。最好的方式还是通过和平协商来解决，既能减少时间和成本，还能维护家庭和谐。
