农村宅基地有证和没证的情况存在，主要原因是前后历史不同。
1982年《宪法》颁布后，农民必须有自己的住房和土地，为此国家出台了《农村集体土地所有权建设用地等问题的规定》。这一规定保障了农民宅基地的产权，也就是说，农民可以拥有自己的建房用地并且拥有产权证明。
但是，在此之前建造的房子就不一定有产权证了。由于早期乡村建设管理比较混乱，很多农民为了方便生活自行建房，政府并没有专门的土地规划、审批、登记等机制。所以，这些早先建设的宅基地并没有产权证，只有口头约定等形式的协议。此后，有的农民经过诉讼等方式获得了宅基地的产权证，有的则没有。所以，目前农村宅基地是否有证书取决于历史的不同，具体情况需要具体分析。
此外，还有一些地方政府没有按照规定将宅基地产权移到农民手中，而是“保留集体所有，个人有承包权，但无产权证”，这种情况下，农民也仅仅是享有使用权，而无法享有产权。这与农村宅基地产权制度初衷并不一致，也已经引起了相关部门的重视，希望在今后的工作中解决这个问题，保障农民宅基地的产权。
