合肥市公证处可以为抚养权协议书进行公证。具体操作流程如下：
1.当事人前往公证处，提交抚养权协议书原件和复印件。
2.公证员会核对原件和复印件是否一致，确认协议书内容无误后，会要求当事人在公证处正本上签名、盖章。
3.公证员根据《中华人民共和国公证法》，对协议书进行公证，即在协议书上附加公证章，并对协议书的真实、有效性做出公证证明。
4.当事人可在公证出具的公证书上查看公证结果，如有异议可以申请复核。
需要注意的是，为了保证公证效力，抚养权协议书应当具备以下条件：
1.协议书应当由双方自愿签署，不得有强迫、威胁、欺骗等情形。
2.协议书应当具备真实性，内容应当准确、明确、完整，不得有虚假陈述、缺项遗漏等情况。
3.协议书应当体现当事人的真实意愿，符合法律规定。
4.协议书应当由当事人签字、盖章确认，以体现其真实意愿。
总之，公证可以为合肥抚养权协议书提供法律效力和权威保障，在离婚或儿童监护权等相关问题上具有重要作用。
