拆迁协议是在城市拆迁过程中最重要的一份文件，是拆迁双方的权力、义务和责任的明确约定，同时也是一份具有法律效力的文件。根据我国有关法律规定，拆迁协议必须留存多久，以备当事人和有关部门查询和证明。
首先要明确的是，拆迁协议的存档方式和留存期限可能因各地实际情况而有所不同。一般来说，根据《中华人民共和国档案法》规定，涉及国家利益、集体利益、公民合法权益的文件， 应该留存至少30年。因此在拆迁协议的留存方面，一般建议存档期限不少于30年。
其次，拆迁协议的留存也要根据当地政策法规的要求来确定。例如在北京市，按照《北京市规划与国土管理条例》的规定，建筑物拆除手续的相关文件要留存20年。而在上海市，按照《上海市文书档案管理规定》的规定， 拆迁协议应当留存20年，涉及财务核算的文件要长达30年。
另外，拆迁协议的留存也需要注意保管的方式。最好是以电子档和纸质档一并保存，以防止因自然灾害等特殊情况可能导致的单一档案遗失。如果是有关拆迁补偿款的协议，更应该加强保管，防止因丢失或损毁等问题，给当事人造成不必要的麻烦。
总之，拆迁协议的留存期限一般应当不少于30年，具体的存档方式和保管措施也要结合当地的实际情况来合理安排。只有这样，我们才能保证拆迁过程的合法、公正和可验证性，维护当事人的合法权益和公共利益。
