在协议离婚的情况下，双方就离婚财产、财产分配、抚养权、子女抚养费、赡养费等进行协商达成一致意见，由此制定相关的协议，以此为基础正式离婚。在这个过程中，双方对财产分配时对方车款付款时间也是需要考虑到的问题。
首先，双方应当理性对待双方车款的问题，没有必要因此产生大的争端，切勿走向极端。如果双方还有一定的关系，可以相互协商，达成一个合理的付款时间，尽可能达到双赢的局面。
如果双方没有任何其他联系，可以根据协议进行支付。在付款时，应当尽量选择一个合适的时间点，最好在协议签署后一个月内支付，以避免因为时间拖延而产生新的纠纷。
倘若一方并不能在协议的时间点上支付车款，可以协商推迟支付日期并制定新的协议，这需要双方耐心、理智处理，双方互相理解、宽容、尊重对方。
总之，处理双方车款的问题需要双方进行充分、合理的协商，并在协议签署后尽快进行付款，避免因此产生新的矛盾和争端。
