在法律上，女方怀孕期间的协议离婚是可以进行的。然而，是否会被法律认可和批准则取决于具体情况。在进行协议离婚时，双方必须达成一致并签署所有必要的文件，包括离婚协议书、财产分割协议、抚养协议书等。
在女方怀孕期间协议离婚时，应该尽可能考虑到胎儿的利益。如果离婚会对胎儿造成伤害，法律将可能不会批准此离婚协议。因此，双方应该在协议离婚前咨询专业人士，例如医生、律师等，以确保协议不会对胎儿产生不利影响。
在协议离婚时，双方还应该考虑到孩子的权益。如果有孩子，应该达成明确的抚养协议，并与法律规定的法定抚养责任一致。抚养协议内容应包括孩子的监护权、抚养权、探视权、与父母亲婚后的子女关系等问题。这样可以确保孩子在父母离婚后能够得到适当的关心和抚养，减少由此产生的悲剧和矛盾。
总之，女方怀孕期间协议离婚是可以进行的，但需要双方经过充分的协商、咨询专业人士并达成有效的协议。协议离婚的方案应充分考虑到胎儿和孩子的利益，尽可能减少对他们的负面影响。经过良好的协商和选择合适的方案，协议离婚可以减少离婚带来的痛苦，让双方更好地面对未来的新生活。
