离婚协议补课费的计算方法应当达成协议的基础上根据具体情况进行确定。一般来讲，补课费的计算应当考虑到以下几个方面：
首先，应当考虑到子女教育情况。具体而言，应当考虑到子女的学习情况、学习方式以及开支情况等因素，以此来确定补课费的具体数额。例如，如果子女需要雇佣专业老师或参加额外的学习班，那么这些开支应当列入计算范围。
其次，应当考虑到离婚协议的具体约定。如果离婚协议中规定了补课费的具体数额或计算方法，那么双方应当按照协议的约定履行。如果离婚协议没有约定补课费，那么双方应当协商达成补课费的具体数额，并将其写入协议中。
最后，应当考虑到收入情况。如果一方的收入较高，那么应当承担较大的补课费开支；如果一方的收入较低，那么应当承担较小的补课费开支。具体的数额应当结合收入情况和子女的实际需求进行衡量，并根据情况进行调整。
总之，补课费的计算方法应当综合考虑多种因素，并达成双方认可的协议。在此基础上，双方应当履行协议，并保证子女的健康成长和教育发展。
