睦州农村宅基地的登记依据《中华人民共和国宅基地条例》和《安徽省宅基地实施办法》进行。具体登记机构分为两种情况。
一种是在居民身份证所在地的乡（镇）政府、农村土地管理部门或者县级宅基地管理机构登记，适用于宅基地所有权人居住地与宅基地不在同一乡（镇）的情况。
另外一种是在宅基地所在地的乡（镇）政府、农村土地管理部门或者县级宅基地管理机构登记，适用于宅基地所有权人居住地与宅基地在同一乡（镇）的情况。
无论哪种情况，农民要想登记自己的宅基地，需要到登记机构中的一个申请，提供相关资料和证明，通过审核后，再进行登记。具体申请材料包括户口簿、土地证、宅基地使用申请书、拆迁安置证明等。
值得注意的是，宅基地登记的时间是限制的，具体以当地宅基地管理机构的规定为准。同时，在登记宅基地时还应当遵循宅基地的规划、管理、使用等相关规定，并保证宅基地的合法性和随时接受监管。
