农村宅基地盖楼是近年来农村改革的一件大事，这种现象在城市外围的农村地区比较普遍，许多农民用自己的宅基地盖上多层楼房，以达到更高的经济效益。但是，农村宅基地盖楼对土地的破坏很大，降低了土地的生产能力，损害了农民的生存环境，所以需要给农民合适的补偿。
首先，政府可以给予农民相应的经济补偿，对于因为农村宅基地盖楼而丧失农田的农民，补偿的经济价值应该等同于农田的价值，并且得到国家和地方政府的允许。
其次，可以采取土地流转的方式，有些农民盖楼后可能用不到所有的土地，政府可以与有租赁土地需求的农民或企业进行合作，将其闲置土地流转出去，由承租人经营环保、生态建设等相关产业，并且使得闲置土地得到了生产利用，也可以通过土地流转降低宅基地盖楼的总量，减轻土地的压力。
最后，政府可以采取租赁、宅基地入股等方式，对农村宅基地所盖的楼房进行监管和管理，对于入股的农民，政府可以在楼房租金中给他们一定的分成，以增加收益。
综上所述，农村宅基地盖楼的补偿方式应该多种多样，不能采取单一的补偿方式。应该是政府、农民合作的方式，既保护农民的利益，又保护土地资源的利用，实现农村宅基地盖楼与农业生产双赢。
