协议离婚在法院中是有效的，因为它是夫妻双方达成的共同意见。在协议离婚中，夫妻双方通过协商和达成共识的方式解决了夫妻关系。当然，在协议离婚的过程中，当事人需要注意合法性和合理性问题。如果协议离婚的内容合法合理，法院会依据夫妻共同提供的协议离婚协议书进行审查，如果审核通过，法院将依照夫妻的意愿，判决同意离婚。
当然，协议离婚也有可能会存在争议。如果协议离婚达不成一致，夫妻双方可以向法院提起离婚诉讼。在此，法院会根据夫妻双方的要求以及事实证据，来裁定夫妻的离婚纠纷。
总之，协议离婚在法院中有用，但也需要注意其合法合理性问题。只有当协议离婚的内容得到法院确认，才能最终达成离婚。因此，在协议离婚的过程中，夫妻双方需要谨慎决定，以确保协议的合法性和合理性，从而确保自己的利益和权益得到保障。
