农村协议离婚的程序与城市协议离婚的程序类似，但具体有一些区别。
第一步，协议离婚前要向当地基层人民法院申请调解，需要婚姻双方一同前往当地人民法院进行调解。调解的目的是希望夫妻重新协商，修补破裂的婚姻关系。如果调解不成功，可以进入下一步程序。
第二步，填写离婚协议书。离婚协议书是协议离婚的一份必要文件，离婚协议书需要夫妻双方协商并签署。协议书中需要包含离婚的原因、子女抚养、财产分割等具体的离婚事宜。协议书必须分别在当地人民法院和公安机关备案。
第三步，提出离婚申请。离婚双方经过协商，可以携带离婚协议书向基层人民法院递交离婚申请。在申请离婚时，需要提供结婚证、身份证、户口本、协议离婚协议书等相关证件备案。
第四步，等待基层人民法院的审核。基层人民法院会认真审核离婚协议书，确保离婚的程序和离婚协议书的内容符合法律规定。如果审核通过，双方到法院进行签字确认，并由法院签发离婚证。
总之，农村协议离婚需要经过调解、填写离婚协议书、提出离婚申请、等待法院审核等几个程序。如果双方遵守协议书中的内容，可以顺利办理协议离婚。
