小三孩子户口跟抚养权是两个不同的概念。户口是指一个人在国内的身份证明，包括姓名、性别、出生日期、籍贯、身份证号码等个人信息。抚养权则是指对未成年子女的抚养、教育、监护的权限，包括生活费、医疗费、教育费等方面的决策权。
小三孩子的户口问题需要根据夫妻离婚的情况来决定。如果夫妻离婚并由法院判决判给小三孩子的抚养权和监护权，那么小三孩子的户口就应该跟随抚养人的户口变更。而且，小三孩子的户口可以在原籍和抚养人所在地两个地方进行变更。
如果离婚时没有涉及小三孩子的抚养权问题，那么小三孩子的户口如果原来在父亲的户口上，那么母亲可以通过申请转移子女户口到自己的户籍上。如果小三孩子已经有了自己的户口，那么则要看抚养协议或者法院判决书上有无描述关于户口变更的事项。如果没有特殊约定，那么小三孩子户口可以通过申请变更。
至于小三孩子的抚养权问题，则需要看夫妻两人是否有子女抚养协议。如果没有协议，那么可以协商后由法院进行判决。一般来说，抚养权会判给父母中的一方，如果判给小三，则需要考虑对小三孩子的影响，包括子女心理健康、教育等方面。如果夫妻两人都不能提供良好的抚养条件，也可以选择抚养权交给其他亲属或者监护部门来处理。
在处理小三孩子户口和抚养权的问题时，需要尊重小三孩子的利益，保障其身心健康和正常成长，同时在法律框架内，让各方达成公平、合理的协议。
